Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
DUSP4Q13115 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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