Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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TRAF3Q13114 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAF3Q13114 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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