Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHAF1BQ13112 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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CHAF1BQ13112 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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CHAF1BQ13112 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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