Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1AQ13111 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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