Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ECH1Q13011 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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