Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GRIK2Q13002 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GRIK2Q13002 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms