Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CNTN1Q12860 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CNTN1Q12860 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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