Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

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Length 1,436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NUP160Q12769 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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NUP160Q12769 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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NUP160Q12769 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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NUP160Q12769 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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NUP160Q12769 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
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NUP160Q12769 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
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NUP160Q12769 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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NUP160Q12769 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NUP160Q12769 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
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