Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CPSF1Q10570 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
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