Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNEQ04844 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms