Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
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CENPFP49454 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
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CENPFP49454 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPFP49454 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CENPFP49454 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPFP49454 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
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CENPFP49454 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPFP49454 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
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CENPFP49454 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC-1.6□□□□□ -2.67
CENPFP49454 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.6□□□□□ -2.67
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CENPFP49454 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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CENPFP49454 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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CENPFP49454 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
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CENPFP49454 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
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CENPFP49454 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CENPFP49454 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
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