Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ECHS1P30084 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ECHS1P30084 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms