Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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PTPRMP28827 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
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PTPRMP28827 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
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PTPRMP28827 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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PTPRMP28827 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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PTPRMP28827 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRMP28827 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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