Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXD9P28356 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HOXD9P28356 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
HOXD9P28356 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXD9P28356 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXD9P28356 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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