Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
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PTPRBP23467 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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