Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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