Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PACSIN3Q9UKS6 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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