Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPRR3Q9UBC9 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms