Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
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ZBED3Q96IU2 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
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ZBED3Q96IU2 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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ZBED3Q96IU2 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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ZBED3Q96IU2 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED3Q96IU2 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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