Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ZNF548Q8NEK5 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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ZNF548Q8NEK5 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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ZNF548Q8NEK5 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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ZNF548Q8NEK5 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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ZNF548Q8NEK5 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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ZNF548Q8NEK5 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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ZNF548Q8NEK5 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZNF548Q8NEK5 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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