Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
UBR3Q6ZT12 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms