Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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CCDC142Q17RM4 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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CCDC142Q17RM4 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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CCDC142Q17RM4 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CCDC142Q17RM4 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CCDC142Q17RM4 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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CCDC142Q17RM4 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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CCDC142Q17RM4 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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CCDC142Q17RM4 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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CCDC142Q17RM4 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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CCDC142Q17RM4 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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CCDC142Q17RM4 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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CCDC142Q17RM4 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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CCDC142Q17RM4 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.93
CCDC142Q17RM4 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC142Q17RM4 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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