Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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