Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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