Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
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VAMP3Q15836 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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VAMP3Q15836 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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VAMP3Q15836 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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VAMP3Q15836 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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VAMP3Q15836 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VAMP3Q15836 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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