Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SF1Q15637 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SF1Q15637 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SF1Q15637 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SF1Q15637 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SF1Q15637 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SF1Q15637 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SF1Q15637 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SF1Q15637 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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