Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TAF1AQ15573 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TAF1AQ15573 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 700.3 ms