Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRKQ15262 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRKQ15262 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236 ms