Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
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EEA1Q15075 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
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EEA1Q15075 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
EEA1Q15075 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
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EEA1Q15075 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
EEA1Q15075 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-1.24□□□□□ -2.61
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