Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
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GPNMBQ14956 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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GPNMBQ14956 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
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GPNMBQ14956 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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GPNMBQ14956 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
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GPNMBQ14956 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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GPNMBQ14956 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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GPNMBQ14956 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GPNMBQ14956 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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