Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.13
CHD4Q14839 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHD4Q14839 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms