Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
UBE4AQ14139 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
UBE4AQ14139 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBE4AQ14139 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBE4AQ14139 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBE4AQ14139 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBE4AQ14139 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBE4AQ14139 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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UBE4AQ14139 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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UBE4AQ14139 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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UBE4AQ14139 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBE4AQ14139 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
UBE4AQ14139 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBE4AQ14139 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBE4AQ14139 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBE4AQ14139 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBE4AQ14139 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBE4AQ14139 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
UBE4AQ14139 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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