Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBFBQ13951 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBFBQ13951 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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