Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE7AQ13946 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms