Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
CCINQ13939 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCINQ13939 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCINQ13939 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCINQ13939 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CCINQ13939 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCINQ13939 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms