Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CAPSQ13938 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CAPSQ13938 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms