Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ITGA9Q13797 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.8 ms