Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
APOFQ13790 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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