| RUNX3 | Q13761 | MIR378A-201 | ENST00000362177 | 66 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.132-201 | ENST00000363421 | 102 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.138-201 | ENST00000363462 | 102 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-595P-201 | ENST00000363944 | 107 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP37-201 | ENST00000365420 | 130 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR549A-201 | ENST00000385268 | 96 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA12-201 | ENST00000391162 | 147 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPS18CP6-201 | ENST00000423587 | 223 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP75-201 | ENST00000491601 | 451 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090255.1-201 | ENST00000495779 | 349 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1053P-201 | ENST00000515930 | 101 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR514B-201 | ENST00000516774 | 80 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA48.11-201 | ENST00000517015 | 89 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021231.3-201 | ENST00000558497 | 370 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR5701-3-201 | ENST00000578890 | 82 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4273-201 | ENST00000582824 | 84 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR5690-201 | ENST00000583739 | 73 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR5701-1-201 | ENST00000585138 | 82 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR5701-2-201 | ENST00000615634 | 82 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL160413.1-201 | ENST00000622780 | 310 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KTN1-207 | ENST00000438792 | 4449 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | E2F5-208 | ENST00000521429 | 1551 nt | TSL 5 BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC233981.2-201 | ENST00000611524 | 1614 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTPRQ-209 | ENST00000616559 | 8165 nt | TSL 5 BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF299P-201 | ENST00000406845 | 1804 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | USP53-202 | ENST00000450251 | 6072 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1115P-201 | ENST00000362490 | 106 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-23P-201 | ENST00000363361 | 144 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-944P-201 | ENST00000364023 | 107 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U8.10-201 | ENST00000384260 | 133 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.496-201 | ENST00000384444 | 101 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR29B2-201 | ENST00000385055 | 81 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRDJ2-201 | ENST00000390475 | 54 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP201-201 | ENST00000410316 | 124 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP494-201 | ENST00000410653 | 129 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNRPG-202 | ENST00000413456 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO2P27-201 | ENST00000420740 | 428 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356010.2-201 | ENST00000422844 | 197 nt | TSL 3 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01870-201 | ENST00000427042 | 390 nt | TSL 3 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNRPG-205 | ENST00000449935 | 428 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYP2C59P-201 | ENST00000457790 | 269 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-717P-201 | ENST00000459076 | 104 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087477.1-201 | ENST00000465747 | 340 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS27P21-201 | ENST00000486977 | 252 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010255.2-201 | ENST00000505209 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022493.2-201 | ENST00000506122 | 481 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-586P-201 | ENST00000517265 | 104 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP005436.2-201 | ENST00000528458 | 252 nt | TSL 5 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC126323.6-201 | ENST00000561701 | 451 nt | TSL 3 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC015818.4-201 | ENST00000580931 | 353 nt | TSL 5 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092070.3-201 | ENST00000596041 | 337 nt | TSL 3 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC080078.3-201 | ENST00000605407 | 463 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR502-201 | ENST00000606349 | 86 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | snoU13.31-201 | ENST00000607291 | 104 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCARNA4-201 | ENST00000629045 | 128 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC242426.3-202 | ENST00000607149 | 2397 nt | TSL 5 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PI15-201 | ENST00000260113 | 6732 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MUC15-203 | ENST00000455601 | 3156 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL359851.1-201 | ENST00000569460 | 4997 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009487.4-201 | ENST00000624969 | 3585 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR369-201 | ENST00000362155 | 70 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNY1P16-201 | ENST00000363063 | 111 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA16.1-201 | ENST00000364597 | 132 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP240-201 | ENST00000365355 | 128 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD42.2-201 | ENST00000365570 | 69 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1040P-201 | ENST00000383974 | 107 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-378P-201 | ENST00000384324 | 107 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA51.11-201 | ENST00000384442 | 131 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA46.1-201 | ENST00000391069 | 153 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCYBP2-201 | ENST00000407745 | 171 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-63P-201 | ENST00000410792 | 194 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354751.2-201 | ENST00000415471 | 210 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006159.2-201 | ENST00000421965 | 692 nt | TSL 2 BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC236972.2-201 | ENST00000434979 | 310 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC133865.1-201 | ENST00000438619 | 339 nt | TSL 3 BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01549-201 | ENST00000440664 | 714 nt | TSL 3 BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027575.1-201 | ENST00000481064 | 460 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018868.1-201 | ENST00000491307 | 315 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGN1P13-201 | ENST00000505795 | 138 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4ATAC7P-201 | ENST00000516280 | 125 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018630.3-201 | ENST00000542637 | 96 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC036222.2-201 | ENST00000579033 | 333 nt | TSL 3 BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4255-201 | ENST00000579351 | 72 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL589935.1-202 | ENST00000612512 | 393 nt | TSL 5 BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005520.5-201 | ENST00000613926 | 164 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U4atac.1-201 | ENST00000618345 | 95 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008121.3-201 | ENST00000618726 | 433 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090517.3-201 | ENST00000625170 | 141 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAP4K3-205 | ENST00000437545 | 3924 nt | TSL 5 BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073544.1-201 | ENST00000600110 | 1595 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIER3-204 | ENST00000381226 | 5210 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.5-201 | ENST00000362334 | 102 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.187-201 | ENST00000363918 | 113 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-99P-201 | ENST00000364721 | 107 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.460-201 | ENST00000384255 | 102 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.463-201 | ENST00000384271 | 102 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA67.5-201 | ENST00000391036 | 107 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP270-201 | ENST00000411361 | 118 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB3P2-201 | ENST00000411913 | 584 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BTF3P4-201 | ENST00000418852 | 495 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |