Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RUNX3Q13761 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms