Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDH18Q13634 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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CDH18Q13634 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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CDH18Q13634 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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CDH18Q13634 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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CDH18Q13634 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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CDH18Q13634 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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CDH18Q13634 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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CDH18Q13634 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDH18Q13634 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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