Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PEX6Q13608 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PEX6Q13608 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms