Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HDAC1Q13547 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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