Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SMAD4Q13485 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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