Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SF3B2Q13435 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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