Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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TCOF1Q13428 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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TCOF1Q13428 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
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TCOF1Q13428 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
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TCOF1Q13428 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
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TCOF1Q13428 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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TCOF1Q13428 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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TCOF1Q13428 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
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TCOF1Q13428 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TCOF1Q13428 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
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