Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ATMQ13315 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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