Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SKP2Q13309 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SKP2Q13309 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms