Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
USP4Q13107 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
USP4Q13107 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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USP4Q13107 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USP4Q13107 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
USP4Q13107 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
USP4Q13107 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
USP4Q13107 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
USP4Q13107 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
USP4Q13107 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
USP4Q13107 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
USP4Q13107 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
USP4Q13107 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP4Q13107 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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