Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TRAF1Q13077 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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TRAF1Q13077 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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