Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
BPTFQ12830 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
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BPTFQ12830 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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BPTFQ12830 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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BPTFQ12830 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BPTFQ12830 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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